原料藥根據它的來源分為天然化學、藥化學合成藥兩大類：
1、化學合成藥又可分為無機合成藥和有機合成藥，無機合成藥為無機化合物(個別為元素)，如用于胃及十二指腸潰瘍的、三硅酸鎂等；有機合成藥主要是由基本有機化工原料，經一系列有機化學反應而制得的藥物（如阿司匹林、氯等）；
2、天然化學藥按其來源也可分為生物化學藥與植物化學藥兩大類，抗生素一般系由微生物發酵制得，屬于生物化學范疇，近年出現的多種半合成抗生素，則是生物合成和化學合成相結合的產品；原料藥中，有機合成藥的品種、產量及產值所占比例大，是化學制藥工業的主要支柱；原料藥質量好壞決定制劑質量的好壞，因此其質量標準要求很嚴，對于其廣泛應用的原料藥都制訂了嚴格的國家藥典標準和質量控制方法。

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