原料藥根據它的來源分為天然化學、藥化學合成藥兩大類：
1、化學合成藥又可分為無機合成藥和有機合成藥，無機合成藥為無機化合物(個別為元素)，如用于胃及十二指腸潰瘍的、三硅酸鎂等；有機合成藥主要是由基本有機化工原料，經一系列有機化學反應而制得的藥物（如阿司匹林、氯等）；
2、天然化學藥按其來源也可分為生物化學藥與植物化學藥兩大類，抗生素一般系由微生物發酵制得，屬于生物化學范疇，近年出現的多種半合成抗生素，則是生物合成和化學合成相結合的產品；原料藥中，有機合成藥的品種、產量及產值所占比例大，是化學制藥工業的主要支柱；原料藥質量好壞決定制劑質量的好壞，因此其質量標準要求很嚴，對于其廣泛應用的原料藥都制訂了嚴格的國家藥典標準和質量控制方法。

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原料藥基本采用方式
1、間歇生產方式：間歇性批次生產指的是在生產過程中，每個單元生產結束后都需要進行檢測，檢驗合格后方能進入下個單元，一個批次產品從投入到產出所對應的工藝階段及時間均是高度一致的，各個環節視同終的產品，一旦某個環節檢驗出產品不合格，即將同一批次的所有產品均視同不合格被抽調出來，進行復驗等工作。
2、連續生產，連續生產的原料藥在一定時間間隔內生產的在規定限度內的均質產品為一批；間歇生產的原料藥可由一定數量的產品經后混合所得的在規定限度內的均質產品為一批；中間體的批號可以與原料藥的批號相一致，也可以相互立。