采用氣調冷藏集裝箱運輸具有保鮮效果好、儲藏損失少、保鮮期長和對果蔬無任何污染的優點。但由于采用氣調設備后，技術要求高，冷藏集裝箱價格高，因此使用還不普遍。

冷藏冷凍集裝箱箱內的溫度升、降速度與箱內裝載貨物有關，當達到設定溫度范圍-18℃±3℃后，應維持其箱內溫度的穩定。但在計算冷藏箱不制冷時箱內溫升時，可采用如下經驗公式作為標準值計算
1）冷卻貨（不通風時）0.0054*(tw-tn）℃/h
2）冷凍貨0.0067*（tw-tn) ℃/h
式中tw和tn分別為外界溫度和箱內溫度℃。

冷凍貨物、一般冷藏貨物及危險品等，由于貨物自身不會發出熱量，而且在裝箱前已預冷到設定的運輸溫度，其堆裝方法非常簡單，僅需將貨物緊密堆裝成一個整體即可。在貨物外包裝之間、貨物與箱壁之間不應留有空隙。但所裝貨物應低于紅色裝載線，只有這樣，冷空氣才能均勻地流過貨物，貨物達到要求的溫度。

冷凍集裝箱保鮮貨物因有呼吸作用而產生二氧化碳、水汽、少量乙烯及其他微量氣體和熱量。堆裝方式應當使冷空氣能在包裝材料和整個貨物之間循環流動，帶走因呼吸產生的氣體和熱量，補充新鮮空氣。有以下兩種標準裝箱方式。

目前在計算冷藏集裝箱的冷負荷時，為了使冷環境溫度在一天中氣候惡劣時刻能滿足設計要求，其溫差傳熱部分的計算室外溫度采用夏季空調室外干球溫度。在計算太陽輻射冷負荷時采用將溫差傳熱冷負荷的值乘以一個系數的辦法。

（1）上海冷藏集裝箱在裝貨過程中，在檢查冷凍裝置，確認冷凍機已停止運轉；
? ? （2）貨物預冷：在裝貨前，要對冷凍集裝箱內使用的墊木和其他襯墊材料要預冷，并要對貨物應進行預冷處理，并預冷到運輸要求的溫度，因冷箱設計制冷能力有限，僅能用于保持貨物的溫度。如果貨物溫度過高，將使制冷系統超負荷工作，導致該系統出現故障，影響貨物安全。
? ? （3）關于二手冷藏集裝箱預冷：一般情況二手冷藏集裝箱不應預冷，因為預冷過的上海冷藏集裝箱一打開門，外界熱空氣進入二手冷藏集裝箱遇冷將產生水汽凝結，水滴會損壞貨物外包裝和標簽，在蒸發器表面凝結的水滴影響制冷量。但在冷庫的溫度與二手冷藏集裝箱內溫度一致，并采用“冷風通道”裝貨時，可以預冷集裝箱。
? ? （4）預檢測試（PTI）：每個二手冷藏集裝箱在交付使用前應對箱體、制冷系統等進行全面檢查，二手冷藏集裝箱清潔、無損壞、制冷系統處于佳狀態。經檢查合格的冷箱應貼有檢查合格標簽。
? ? （5）裝箱前準備工作：根據不同易腐貨物應確認下述事項：佳溫度設定；新鮮空氣換氣量設定；相對濕度設定；運輸總時間；貨物體積；采用的包裝材料和包裝尺寸；所需的文件和單證等。
? ? （6）裝箱前及裝貨時應注意：設定的溫度應正確；設定的新鮮空氣換氣量應正確；設定的相對濕度應正確；裝箱時制冷系統應停止工作；箱內堆裝的貨物應低于紅色裝載線和不超出T型槽的垂直面；箱內堆裝的貨物應牢固、穩妥；箱內堆裝貨物的總重量應不超過冷箱大允許載重量；二手冷藏集裝箱裝貨后總重量（包括附屬設備的重量）在運輸途中不應超過任一途經國的限重。
? ? （7）脫離制冷時間：各種運輸方式之間的交接可能出現短途運輸或制冷系統故障，造成停止制冷。對冷凍和冷藏保鮮貨物短時間地停止制冷狀態是允許的。許多產品出現幾小時的停止制冷可以接受，但并非所有貨物都如此。對任何冷藏貨物均不允許出現長時間地停止制冷。對特種貨物和溫度敏感貨物應保持制冷系統連續工作，避免任何溫度波動造成貨物質量下降。