根據制冷方式分類
　　(1)外置式冷藏集裝箱。無制冷裝置，箱體隔熱結構良好，箱端處有軟管連接器，可與船上或陸上冷凍站的制冷裝置連接，供給箱體冷源。
　　(2)內藏式冷藏集裝箱。箱體設有制冷裝置，由船上或陸上電源供電，或自備發電機供制冷裝置運行使用，以向集裝箱供冷。
　　(3)冷凍板冷藏集裝箱。利用冷凍板低溫共晶溶液進行蓄冷并向集裝箱提供冷源。
　　(4)液氮或干冰冷藏集裝箱。利用液氮噴淋或干冰向集裝箱提供冷源。
　　(5)氣調冷藏集裝箱。利用控制集裝箱內空氣中的氧、二氧化碳和乙烯等氣體的濃度，抑制果蔬的呼吸和催熟作用，并把向內溫度降至所需貯藏溫度的一種特種冷藏集裝箱。

冷藏集裝箱優點：
(1)冷藏集裝箱裝載容積利用率高，營運調度靈活，使用經濟性強。
　　(2)冷藏集裝箱使用中可以整箱吊裝，裝卸，運輸費用相對較低。新型冷藏集裝箱結構和技術性能更合理，有廣泛的適用性。
　　(3)冷藏集裝箱在一定條件下。可以當作活動式冷庫使用，以調節市場供應，給營銷者帶來良好的經濟效益。
　　(4)冷藏集裝箱可用于多種交通運輸工具進行聯運，中間無需貨物換裝，而且貨物可不間斷地保持在所要求的低溫狀態。
　　(5)對國內和國際間的“冷鏈”運輸，可以從產地到銷售點，實現“國到國”直達運輸，為各類食品的新鮮度，提供了佳貯運條件。

按結構分類
按結構分類集裝箱可分為三類：
（1）內柱式（linterior post type container）與外柱式集裝箱（outsider post type container），主要指鋁合金集裝箱，內柱式集裝箱是指側柱（或端柱）位于倒壁或端壁之內；外柱式集裝箱是指側柱（或端柱）位于倒壁或端壁之外；
（2）折疊式集裝箱（collapside container），指集裝箱的主要部件（側壁、端壁和箱頂）能簡單地折疊或分解，再次使用時可以方便的再組合起來；
（3）薄殼式集裝箱（monocoque container），是把所有部件組成一個鋼體，它的優點是重量輕，可以適應所發生的扭力而不會引起變形。

冷藏集裝箱裝貨注意事項
　　(1)冷凍集裝箱在裝貨過程中，在檢查冷凍裝置，確認冷凍機已停止運轉;
　　(2)貨物預冷：在裝貨前，要對冷凍集裝箱內使用的墊木和其他襯墊材料要預冷，并要對貨物應進行預冷處理，并預冷到運輸要求的溫度，因冷箱設計制冷能力有限，僅能用于保持貨物的溫度。如果貨物溫度過高，將使制冷系統超負荷工作，導致該系統出現故障，影響貨物運輸。
　　(3)關于冷藏集裝箱預冷：一般情況冷藏集裝箱不應預冷，因為預冷過的冷藏集裝箱一打開門，外界熱空氣進入冷藏集裝箱遇冷將產生水汽凝結，水滴會損壞貨物外包裝和標簽，在蒸發器表面凝結的水滴影響制冷量。但在冷庫的溫度與冷藏集裝箱內溫度一致，并采用“冷風通道”裝貨時，可以預冷集裝箱。
　　(4)預檢測試(PTI)：每個冷藏集裝箱在交付使用前應對箱體、制冷系統等進行檢查，冷藏集裝箱清潔、無損壞、制冷系統處于理想狀態。經檢查合格的冷箱應貼有檢查合格標簽。
　　(5)裝箱前準備工作：根據不同易腐貨物應確認下述事項：理想溫度設定;新鮮空氣換氣量設定;相對濕度設定;運輸總時間;貨物體積;采用的包裝材料和包裝尺寸;所需的文件和單證等。
　　(6)裝箱前及裝貨時應注意：設定的溫度應正確;設定的新鮮空氣換氣量應正確;設定的相對濕度應正確;裝箱時制冷系統應停止工作;箱內堆裝的貨物應低于紅色裝載線和不超出T型槽的垂直面;箱內堆裝的貨物應牢固、穩妥;箱內堆裝貨物的總重量應不超過冷箱允許載重量;冷藏集裝箱裝貨后總重量(包括附屬設備的重量)在運輸途中不應超過任一途經國的限重。
　　(7)脫離制冷時間：各種運輸方式之間的交接可能出現短途運輸或制冷系統故障，造成停止制冷。對冷凍和冷藏保鮮貨物短時間地停止制冷狀態是允許的。許多產品出現幾小時的停止制冷可以接受，但并非所有貨物都如此。對任何冷藏貨物均不允許出現長時間地停止制冷。對特種貨物和溫度靈敏貨物應保持制冷系統連續工作，避免任何溫度波動造成貨物質量下降。

冷藏集裝箱貨物的包裝
　　包裝是冷藏貨物運輸的重要組成部分，是防止貨物損壞和污染的基礎。適當的設計和的包裝材料應能承受冷凍和運輸全過程。包裝應能夠：
　　(1)防止貨物積壓損壞;
　　(2)承受運輸途中發生的沖擊;
　　(3)標準的外型尺寸適于貨盤或直接裝入冷箱;
　　(4)防止貨物脫水或減低水汽散失速度;
　　(5)防止氧化的氧氣障礙作用;
　　(6)在低溫和潮濕情況下保持強度;
　　(7)防止串味;
　　(8)經得住-30℃或更低的溫度;
　　(9)能支持堆放高度2.3米(7英尺10英寸)的貨物。
　　由于上述原因，不同貨物要有不同的設計和達到質量要求的包裝材料。易腐爛水果和蔬菜應使用能使空氣在貨物中間循環并帶走因貨物呼吸產生的氣體、水汽和熱量的包裝。

冷藏集裝箱貨物的裝載
根據冷凍貨物、保鮮貨物、一般冷藏貨物及危險品等特性的不同，在冷箱內的堆裝方式也不同。
　　冷凍貨物、一般冷藏貨物及危險品等，由于貨物自身不會發出熱量，而且在裝箱前已預冷到設定的運輸溫度，其堆裝方法非常簡單，僅需將貨物緊密堆裝成一個整體即可。在貨物外包裝之間、貨物與箱壁之間不應留有空隙。但所裝貨物應低于紅色裝載線，只有這樣，冷空氣才能均勻地流過貨物，貨物達到要求的溫度。