與普通生活污水相比，醫療污水的排放更加復雜。醫療污水來源和成分復雜，含有病原微生物、有毒有害的理化污染物和放射性污染，具有空間污染、急性感染和潛伏感染的特點。如果得不到有效的治療，它將成為流行病傳播的重要途徑，并嚴重污染環境。

通常情況下，醫院污水需要集中收集，經醫院內部的醫療污水處理系統處理消毒后，流入城市污水管網，再經污水處理廠處理后可作為終水排放。其中，醫療污水處理的過程包括網格處理(剝離顆粒較大的雜物，如石塊、塑料袋等。)、生化處理(好氧部分)和厭氧處理(厭氧部分，好氧和厭氧過程均可達到有效殺菌)，之后進行24小時沉淀處理，加藥消毒(此階段一般使用活性氧消毒粉)，從而監測COD、BOD等相關指標的達標情況。另外，在集中處理之前，醫療污水是通過的管道收集的，這個過程一般是封閉的。

醫療污水處理工藝選擇的原則：
　　a、傳染病醫院采用二級處理，并需進行預消毒處理。

　　b、處理出水排入自然水體的縣及縣以上醫院采用二級處理。

　　c、處理出水排入城市下水道的綜合醫院推薦采用二級處理，對采用處理工藝的加強處理效果。

　　d、對于經濟不發達地區的小型綜合醫院，條件不具備時可采用簡易生化處理作為過渡處理措施，之后逐步實現二級處理或加強處理效果的處理。

醫療污水處理的步驟：
　　（1）醫院生活污水進化糞池，經化糞池處理后進格柵池，經格柵去除大懸浮物后進入調節池，柵余物轉至站內醫療廢物垃圾池；

　　（2）污水經格柵池后進入調節池，調節池污水通過提升泵送至水解酸化池，通過水解酸化作用，將大分子物質分解為小分子，提高污水生化效果，減輕接觸氧化池處理負荷；

　　（3）污水經水解酸化池后進接觸氧化池，通過附著在填料上的生物的吸附、氧化等作用，將污水中的有機污染物逐步氧化成二氧化氯、水或合成細胞物質，使污水得到凈化，設置于水解酸化池與接觸氧化池之間的混合液回流泵，將接觸氧化池污水回流至水解酸化池，實現脫氮目的；

　　（4）接觸氧化池出水加絮凝劑反應生產礬花后進沉淀池，進行泥水分離，沉淀池出水入消毒池，消毒池中通入二氧化氯并通過混勻器混勻，進行消毒處理以后，較后通過脫氯作用后排放；

　　（5）沉淀池中的進行泥水分離以后，污泥通過污泥泵輸送至污泥濃縮池再沉淀以后，上清返回水解酸化池再次循環處理；污泥經脫水、干化以后進行填埋處理。

實驗室廢水處理設備的調試工作：
　　調試前檢查工作：
　　1、空轉點開點關風機、水泵轉動運轉情況，電控柜元件運作可靠性。

　　2、檢查設備間風機的潤滑機油加注情況。

　　3、檢查內、外部管路連接牢固情況。

　　4、檢查內、外部電路連接情況。

　　5、地埋式一體化污水處理設備內注入污水，檢查各管路連接處有無滲漏情況.

　　6、啟動風機，檢查生活污水裝置所有設備運轉情況，有無異常震動、噪音等。

調試步驟：
　　1、清水注滿接觸生化池。

　　2、啟動風機，對池內污水進行曝氣充氧。

　　3、重新進水，繼續曝氣。

　　4、如此反復運行，每天進水時間相對延長。

　　5、同時也可觀察接觸生物池內填料情況。

　　6、微生物的馴化需要較長時間，這樣可加快生物膜的形成。