貨物在運輸時要冷藏，那么在冷藏時要注意貨物的保鮮，尤其是出口冷藏要特別注意。大多數貨主在出口冷藏（凍）貨物裝箱時，喜歡將集裝箱預冷至設定溫度，這種做法其實是不科學的，對貨物和集裝箱都有可能帶來負面影響，從而不能的集裝箱冷藏（凍）運輸。原因是，如果裝貨前預冷過集裝箱，那么在打開柜門準備裝貨時，外界高溫度、高濕度的空氣將會大量地進入柜內與低濕度、低溫度的空氣匯合，這會使得大量的水珠凝結在集裝箱內壁上，這些水珠不僅會滴到貨物的外包裝上從而影響外包裝的美觀，而且會影響集裝箱制冷系統的運作，從而有可能對貨物品質帶來不利影響。因為這些冷凝出來的水份由集裝箱制冷系統中的蒸發器來排除，而這些冷凝出來的水份經過蒸發器盤管時就會結冰、這將使得制冷系統進行一次短暫的除霜過程。另一方面，蒸發器還除去以下三部分熱量：裝貨時通過柜門而直接進入柜內的熱量；穿過柜壁而透進柜內的熱量；鮮貨活貨因新陳代謝而不斷產生的熱量。可以想象，如果冷藏集裝箱需要除去額外熱量和濕度越多，那么主要應用來冷卻貨物本身的制冷量就會越少。因此，出口冷藏（凍）貨物裝箱時好不要預冷集裝箱。當然，在預冷的集裝箱溫度與冷庫溫度相同，并且在冷庫與集裝箱之間有一條隔熱通道的情況下是可以在裝貨前預冷集裝箱的。

在影響貨運質量的情況發生時，未能有效管理動力設備和確定并消除制冷系統的問題，是導致貨損實際發生的一個重要因素。因此，在裝運冷藏貨物時，船員了解冷藏集裝箱的管理規范，并富有監測經驗和技術是非常重要的。
由于冷藏貨物的貿易性質，特別是易腐貨物，承運人通常面臨著按照裝運時貨物狀況及時交付貨物的壓力非常大。實際操作過程中經常會有短時間遲延，在運輸諸如葡萄或香蕉之類的貨物時，即使是很短暫的遲延，也可能對貨物質量產生重大影響，并導致大額索賠。承運人對此應特別注意。

集裝箱重箱或空箱進行交接、保管和堆存的場所。有些國家對集裝箱堆場并不分前方堆場或后方堆場，統稱為堆場。集裝箱后方堆場是集裝箱裝卸區的組成部分。是集裝箱運輸"場到場"交接方式的整箱貨辦理交接的場所（實際上是在集裝箱卸區"大門口"進行交接的）。

海港以外的集裝箱運輸的中轉站或集散地。它的作用除了沒有集裝箱船的裝卸作業外，其余均與集裝箱裝卸區業務相同。中轉站或內陸站的度量，包括集裝箱裝卸港的市區中轉站、內陸城市、內河港口的內陸站均在內。
　　集裝箱貨運站（container freight station 簡稱：CFS）

為拼箱貨裝箱和拆箱的船、貨雙方辦理交接的場所。承運人在一個港口或內陸城市只能委托一個集裝箱貨運站的經營者。由它代表承運人辦理下列主要業務：（1）拼箱貨的理貨和交接。（2）對貨物外表檢驗如有異狀時，就辦理批注。（3）拼箱貨的配箱積載和裝箱。（4）進口拆箱貨的拆箱和保管。（5）代承運人加鉛封并簽發站收據。（6）辦理各項單證和編制等。

各航運公會為了壟斷各自航線上的集裝箱運輸，都分別制訂了供貨方使用的集裝箱運輸規則。這些規則，是由各公會針對公會營運范圍內的航線情況制訂的。因此，各公會的規則內容各不相同，但基本精神是相同的，即船貨雙方的責任是一樣的。規則內容一般包括以下幾個方面：
　　（1）集裝箱裝卸港，集散運輸。
　　（2）集裝箱運輸術語解釋。
　　（3）各種運輸交接方式船貨雙方責任。
　　（4）訂艙手續及貨運資料申報。
　　（5）各類條款包括提單，加批條款，港口條款和意外條款。
　　（6）提單簽發。
　　（7）設備交接手續，使用免費時間和滯期費計收。
　　（8）交貨手續。
　　（9）運費計算方法及支付。
　　（10）各種費用項目計收辦法，費率變更規定。
　　（11）幣制，貶值，增值規定。
　　（12）內陸運輸規定及收費