干燥場所應保持干燥，可通過安裝除濕設備將空氣濕度控制在較低水平，一般相對濕度宜控制在 40% - 60%。同時，在包裝前要對產品進行濕度檢測，確保其符合質量標準。

溫度過高會導致卵磷脂氧化、變性，影響產品質量，如使卵磷脂的活性成分喪失，降低其營養價值。一般來說，噴霧干燥的進風溫度通常控制在 150 - 200℃，出風溫度在 80 - 90℃；冷凍干燥時，預凍溫度需達到 - 40℃至 - 20℃，升華干燥階段溫度控制在 - 20℃至 20℃左右，解析干燥階段溫度可適當提高至 30 - 40℃。

環境濕度過高會使干燥后的卵磷脂重新吸收水分，導致產品含水量增加，影響儲存穩定性，容易引起微生物滋生和產品變質。

精選原料：選用的大豆、蛋黃等富含卵磷脂的原料。這些原料需經過嚴格篩選，去除雜質、變質部分，以產品質量。例如，大豆要選擇顆粒飽滿、無病蟲害的，蛋黃要確保新鮮、無異味。
脫臭：采用減壓蒸餾的方法，在高溫、高真空條件下，將卵磷脂中的異味物質去除，得到氣味的精煉卵磷脂。
蛋黃卵磷脂提取（以蛋黃為例）
攪拌分離：將蛋黃從雞蛋中分離出來，加入適量的水進行攪拌，使蛋黃中的卵磷脂等成分充分溶解在水中，形成蛋黃乳液。
離心分離：利用離心機對蛋黃乳液進行離心處理，使卵磷脂等油脂成分與水相分離，得到蛋黃油。