產品成本高。以生物航空燃料為例，其成本是石油航空煤油的數倍，在成本上沒有競爭優勢。雖然航空公司也會購買一定數量的生物航空燃料，但考慮到成本，購買量不會很大。此外，成品油的生產還將產生外部間接成本。
例如，為了監督廢油的去向，促進廢油的回收和利用，英國已迫使餐館安裝烹飪廢油回收系統；荷蘭廢油回收由資助，降低了生物航空燃料精煉企業的高回收成本；在日本，廢油由回收公司回收，并由購買。如果生物燃料要完全取代石油產品，不僅需要解決成本問題，還需要建立一個完整的生物燃料供應鏈。
閃點和燃油都是溫度值。植物油燃料的閃點相對較低。常溫下，其閃點約為100。因此，沒有的燃燒設備或點火器，在普通環境中無法產生能量釋放。隨著各行各業的不斷發展，人們越來越重視環境保護。使該行業綠色環保。
